图甲所示的进化树表示了几种生物之间的亲缘关系，图乙表示不同年代形成的地层，请据图回答问题：

(1)图甲中，与c亲缘关系最近的生物是______；a、b、c、d四种生物的共同祖先是______。
(2)在图乙所示的三个地层中均发现了生物化石。比较低等、简单的生物形成的化石最可能存在于______地层中。
(3)化石是保存在地层中古代生物的遗体、______和______，是研究生物进化最重要的证据。科学家从地层中发现的孔子鸟化石等证明鸟类可能起源于______。
(4)在最早形成的地层中，没有发现生物化石，说明______。