粤港澳大湾区主要利用的水资源来自珠江水系，东部为东江，年均径流量235亿m³，综合开发利用率为38％。西部为西江，年均径流量2163亿m³，综合开发利用率为1.3％。粤港澳大湾区首个超大型水利工程——珠江三角洲水资源配置工程已全面开工建设，将引西江优质水源，向东至东莞市松木山水库、深圳市罗田水库、公明水库，输水线路总长度113.2千米。为最大程度减少对沿线土地及生态环境的影响，工程采用深层输水方案，比传统的明渠输水方式节约近90％的土地。工程全线采用深埋盾构管道方式，在地下40～60米的空间建造输水管道，最大程度保护粤港澳大湾区生态环境。下图为珠江三角洲水资源配置工程示意图。

2019年5月6日，粤港澳大湾区建设的又一超级工程珠江三角洲水资源配置工程（下图）全面开工建设。该工程从西江水系向珠三角东部地区引水，全长100多千米，输水线路从地下贯穿大湾区，拟2024年建成，届时将有效改变目前东莞、深圳、香港从东江取水的单一供水格局，同时缓解东江缺水状况。

雷州半岛自古以来就是“苦早之地”,十年九早成为常态。为改善这一困境，环北部湾广东水资源配置工程应运而生。该工程于2022年8月正式启动，从西江干流取水，调水至雷州半岛南部，供水范围覆盖茂名、湛江等地。工程的主要任务是为城乡生活和工业供水，兼顾农业灌溉。下图为环北部湾广东水资源配置工程（部分）线路示意图。