十二届全国人大一次会议通过的《国务院机构改革和职能转变方案》强调：政府职能转变是深化行政体制改革的核心；转变国务院机构职能，必须处理好政府与市场、政府与社会、中央与地方的关系。

国务院机构改革重点围绕转变职能和理顺职责关系，稳步推进大部门制改革。根据改革方案，撤销铁道部，将铁路发展规划和政策的行政职责划入交通运输部，整合加强卫生和计划生育、食品药品、新闻出版和广播电影电视、海洋、能源管理机构。改革后，除国务院办公厅外，国务院设置组成部门25个。